La Facultad de Ciencias Agropecuarias y Recursos Naturales cuenta con las Escuelas de Ingeniería en Ciencias Agrícolas y Ciencias Animales y con el Instituto de Acuicultura de los Llanos, a los cuales pertenecen 11 líneas de investigación, aprobadas mediante el Acuerdo 004 de 2015, relacionadas en la tabla, las cuales son de apoyo para los procesos de investigación desarrollados desde la Especialización.